Juan Bautista Avila Velásquez desapareció alrededor de la tercera semana de octubre de 1973, en el trayecto desde la Cárcel a la Comisaría de Carabineros ubicada en calle Beauchef, en la ciudad de Valdivia, después de haber estado detenido e incomunicado durante 21 días. Desde entonces se desconoce su paradero.
Juan Avila fue detenido aproximadamente el 18 de septiembre de 1973, en el interior de Liquiñe, junto con su hermana Yolanda Avila Velásquez y su cuñado José Gregorio Liendo Vera, conocido como «Comandante Pepe», alto dirigente del Movimiento de Izquierda Revolucionaria (MIR) de la zona de Panguipulli. Los tres detenidos permanecieron unos días en el retén de Carabineros de esa localidad y luego se les trasladó a la Cárcel Pública de Valdivia. En el recinto policial, Juan Avila fue torturado y en la cárcel recibió malos tratos, por lo que su estado físico y psicológico eran muy precarios y casi no podía caminar. El día de su desaparición salió de la cárcel junto con un grupo de detenidos, todos los cuales habían recibido la orden de presentarse de inmediato en la Comisaría de Carabineros de calle Beauchef para obtener un salvoconducto. Sin embargo, debido a su estado físico debió separarse del grupo y detenerse a descansar. Desde ese momento se desconoce su paradero.
Considerando los antecedentes reunidos y la investigación realizada por esta Corporación, el Consejo Superior declaró a Juan Bautista Avila Velásquez víctima de violación a los derechos humanos.

El 18 de septiembre de 1973 es ejecutado Jorge Ávila Pizarro, médico del Hospital Psiquiátrico, militante del MIR detenido y trasladado al Estadio Nacional. El 20 de diciembre de 1973 la familia logró averiguar que Jorge Ávila Pizarro se encontraba muerto desde el 18 de Septiembre de 1973 y enterrado en el Patio 29 del Cementerio General. La causa de la muerte: «herida de arma de fuego facio'cráneo'encefálica y herida de bala torácica izquierda».
El 18 de septiembre de 1973 es detenido en su domicilio del campamento «Trabajadores al Poder», Juan Guillermo Fuentes Ravanal, 24 años, obrero y militante del MIR, ese mismo día junto a otros dos militantes de izquierda de ese campamento fueron fusilados en el Regimiento de Quillota.
El 18 de septiembre, 19:30 horas detienen en Cauquenes a Jorge Yáñez Olave, Periodista, Jefe del Comité Local del MIR y Jaime Torres Salazar, Dirigente obrero del MIR. Ambos estaban trabajando en la conformación del Sindicato de Celulosa Constitución (CELCO) fueron trasladados para ser fusilados en la playa de Constitución junto a otros tres militantes de izquierda y luego desaparecieron sus cuerposEl 18 de septiembre de 1973, (aproximadamente) fue detenido por carabineros Juan Bautista Ávila Velásquez militante del MIR, en el interior de Liquiñe, junto con su hermana Yolanda Ávila Velásquez y su cuñado José Gregorio Liendo Vera, alto dirigente del MIR de la zona de Panguipulli. Es desaparecido alrededor de la tercera semana de octubre de 1973, en el trayecto desde la Cárcel a la Comisaría de Carabineros ubicada en calle Beauchef, en la ciudad de Valdivia, después de haber estado detenido e incomunicado durante 21 días.
El 18 de septiembre de 1973 en horas de la mañana, fue detenido con su hijo, por una patrulla del Regimiento de Paracaidistas y Fuerzas Especiales de Peldehue, Manuel Segundo Maldonado Miranda 43 años, obrero agrícola, dirigente campesino del MCR, Presidente del Asentamiento "El Esfuerzo Campesino" ex -fundo Santa Inés de Lampa. El 20 de septiembre es asesinado y su cuerpo lanzado a la vía pública. La autopsia señala que tenía múltiples heridas de bala cráneo encefálicas y torácico abdominales.