Héctor Manuel Pizarro murió ese día a las 21:30 horas, en San Pablo esquina Manuel Rodríguez, por traumatismo cráneo encefálico y torácico abdominal complicado por heridas múltiples de proyectiles, según consta en el Certificado Médico de Defunción del Instituto Médico Legal.

De acuerdo con la declaración de su cónyuge, testigo de los hechos, Héctor Pizarro fue detenido alrededor de las 20:00 horas del 18 de septiembre de 1973, en horas de toque de queda, a treinta metros de su casa, en calle San Pablo con Manuel Rodríguez, por efectivos de Carabineros, quienes lo condujeron a la Tercera Comisaría.

Los aprehensores le señalaron a la cónyuge que su marido sería puesto en libertad al día siguiente.

Sin embargo, la mañana del 19 de septiembre, vecinos le avisaron que habían encontrado su cuerpo, con múltiples heridas de bala, bajo el puente de la Carretera Panamericana ubicado en el mismo sector donde se produjo el arresto. Sus restos fueron entregados a la familia en el Instituto Médico Legal.

Considerando los antecedentes reunidos y la investigación realizada por esta Corporación, el Consejo Superior llegó a la convicción de que Héctor Manuel Pizarro fue detenido y ejecutado extrajudicialmente por agentes del Estado y lo declaró víctima de violación de derechos humanos.